研究报告

日本蛇根草糖基转移酶基因 OjGT1 的克隆与生物信息学分析  

孙威1 , 林建1 , 申欢1 , 马玲1 , 鞠志刚2 , 乙引1,3
1 贵州师范大学生命科学学院, 植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550025; 2 贵阳中医学院, 药学院, 贵阳, 550025; 3 西南喀斯特山地生物多样性保护重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2018年03月14日    接受日期: 2018年04月19日    发表日期: 2019年02月20日
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摘要

糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过 RT-PCR 方法成功克隆得到OjGT1 基因完整的 cDNA 序列,随后对 OjGT1 的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1 基因完整的 CDS 长度为 1 413 bp,翻译形成蛋白的分子量为 52.087 kD,等电点为 5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与三级结构分析显示,OjGT1 蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是 螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1 基因的成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据。

关键词
日本蛇根草;OjGT1;基因克隆;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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